Две вещи ненеавижу:

1) когда всю конфигурацию сваливают в одну портянку

2) когда инклудами злоупотребляют до такой степени, что в корневой файл инклудится другой файл, все содержимое которого - это инклуд какого-то третьего файла или директории.